Hướng dẫn mới nhất từ Cục Thuế giải đáp vướng mắc cho Doanh nghiệp FDI-KOCHAM

TÀI NGUYÊN & CÔNG NGHỆ Văn bản & Quy định
, ,
1

Chào anh chị em,

Vừa qua, Cục Thuế đã ban hành Công văn số 5200/CT-CS ngày 24/07/2026 gửi Hiệp hội doanh nghiệp Hàn Quốc tại Việt Nam (KOCHAM) để trả lời hàng loạt vướng mắc quan trọng liên quan đến thủ tục hoàn thuế, ưu đãi thuế, thỏa thuận giá (APA) và đặc biệt là rủi ro chi phí đối với lao động thuê ngoài.

Mình xin tổng hợp chi tiết từng nội dung để anh chị em, đặc biệt là các bạn làm kế toán, nhân sự, và pháp chế tại các doanh nghiệp FDI nắm bắt, áp dụng chính xác:

1. Về hoàn thuế Giá trị gia tăng (GTGT) trong giai đoạn đầu tư và xuất khẩu

  • Phân loại hồ sơ để đẩy nhanh tiến độ: Cơ quan thuế sẽ phân loại hồ sơ để giải quyết nhanh chóng đối với các hồ sơ đầy đủ, đáp ứng điều kiện và có rủi ro thấp nhằm bảo đảm quyền lợi doanh nghiệp. Đồng thời, tăng cường hướng dẫn ngay từ khâu kê khai để hạn chế việc phải giải trình nhiều lần.
  • Xử lý hồ sơ rủi ro: Với các hồ sơ có dấu hiệu rủi ro về hóa đơn, nguồn gốc hàng hóa, giao dịch hoặc dòng tiền, cơ quan thuế sẽ áp dụng quản lý rủi ro để kiểm tra, xác minh theo đúng trình tự.
  • Điện tử hóa hoàn thuế (Từ 01/07/2026): Theo Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15 mới có hiệu lực, ngành Thuế tiếp tục đẩy mạnh điện tử hóa quy trình, kết nối khai thác dữ liệu từ các cơ quan liên quan để rút ngắn thời gian kiểm tra và phòng chống gian lận hoàn thuế.

2. Xác định tiền thuê đất đối với dự án đầu tư

  • Trách nhiệm của cơ quan thuế được căn cứ theo điểm a khoản 3 Điều 44 Nghị định số 103/2024/NĐ-CP (sửa đổi bởi Nghị định 291/2025/NĐ-CP).
  • Việc tính tiền sử dụng đất, tiền thuê đất sẽ được cơ quan thuế thực hiện dựa trên Phiếu chuyển thông tin do cơ quan có chức năng quản lý đất đai và các cơ quan khác chuyển đến. Trường hợp doanh nghiệp có vướng mắc cụ thể cần cung cấp hồ sơ đầy đủ để cơ quan thuế phối hợp xem xét.

3. Áp dụng thuế suất thuế GTGT 0% đối với giao dịch xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ

Cục Thuế đã ban hành riêng Công văn số 4425/CT-CS ngày 01/07/2026 đính kèm để giải đáp chi tiết nội dung này:

  • Nguyên tắc chung: Hàng hóa xuất nhập khẩu tại chỗ chỉ áp dụng thuế suất thuế GTGT 0% khi đáp ứng đầy đủ điều kiện về hợp đồng, chứng từ thanh toán qua ngân hàng và tờ khai hải quan hợp lệ.
  • Với giao dịch phát sinh TRƯỚC ngày 01/07/2025: Xác định dựa trên quy định pháp luật tại thời điểm phát sinh (Luật Hải quan, Nghị định 08/2015/NĐ-CP…). Nếu cơ quan thẩm quyền xác định tờ khai hải quan không phù hợp hoặc không đáp ứng điều kiện, cơ quan thuế sẽ không có cơ sở giải quyết hoàn thuế GTGT 0%.
  • Với giao dịch phát sinh TỪ ngày 01/07/2025: Căn cứ theo Luật số 90/2025/QH15 (bổ sung Điều 47a vào Luật Hải quan) và Nghị định 167/2025/NĐ-CP. Luật mới làm rõ quy định hàng hóa xuất nhập khẩu tại chỗ là hàng hóa giao nhận tại Việt Nam theo chỉ định của thương nhân nước ngoài. Việc áp dụng các quy định mới này không làm thay đổi nguyên tắc xử lý đối với các giao dịch cũ.
  • Cơ quan thuế sẽ xem xét từng hồ sơ cụ thể của doanh nghiệp để quyết định hoàn thuế, chứ không kết luận chung cho toàn bộ hiệp hội.

4. Về Nguyên vật liệu được cung cấp không phải thanh toán (FOC)

  • Căn cứ Nghị định số 320/2025/NĐ-CP, hàng hóa nhận được không phải thanh toán (bao gồm quà biếu, tặng, hỗ trợ…) được xác định là thu nhập khác.
  • Đáng lưu ý: Các khoản thu nhập này KHÔNG được hưởng ưu đãi thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN) theo khoản 9 Điều 23 Nghị định 320/2025/NĐ-CP.
  • Việc nguyên vật liệu FOC có thuộc thu nhập chịu thuế hay không phải căn cứ rất chặt chẽ vào bản chất giao dịch, hợp đồng, quyền sở hữu, mục đích sử dụng và hạch toán kế toán thực tế.

5. Thỏa thuận trước về phương pháp xác định giá tính thuế (APA)

  • Luật Quản lý thuế 2025 (hiệu lực từ 01/07/2026) mở rộng cơ sở pháp lý, thu thập dữ liệu minh bạch từ nhiều nguồn (CSDL thương mại, chứng khoán, hợp tác quốc tế…) để phục vụ đàm phán APA.
  • Nguyên tắc công bằng: Việc lựa chọn, ưu tiên xử lý hồ sơ APA căn cứ vào tính chất giao dịch, sự đầy đủ của hồ sơ, thời gian đề nghị và nguồn lực của cơ quan thuế. Cơ quan thuế khẳng định rõ: Không ưu tiên xử lý hồ sơ chỉ dựa trên quốc tịch của nhà đầu tư hoặc tư cách thành viên của một hiệp hội, đảm bảo quản lý khách quan và công bằng cho mọi người nộp thuế.

6. Rủi ro về thuế đối với hoạt động Thuê lại lao động (Lao động thuê ngoài)

Đây là điểm các doanh nghiệp sản xuất cần đặc biệt chú ý, được dẫn chứng theo Công văn 3705/CT-CS ngày 05/06/2026:

  • Theo Nghị định 145/2020/NĐ-CP, chỉ có 20 danh mục công việc được phép cho thuê lại lao động (ví dụ: sản xuất, lắp đặt thiết bị truyền hình, viễn thông…).
  • Tuy nhiên, theo xác nhận từ Bộ Khoa học & Công nghệ và Bộ Nội vụ, hoạt động “sản xuất linh kiện điện tử” (Mã ngành 261) KHÔNG thuộc danh mục 20 công việc được phép thực hiện cho thuê lại lao động.
  • Hệ quả pháp lý về Thuế: Nếu doanh nghiệp phát sinh các khoản chi phí vi phạm pháp luật chuyên ngành (sử dụng lao động thuê ngoài sai danh mục quy định), thì khoản chi này sẽ không được trừ khi tính thuế TNDN và không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào.

:backhand_index_pointing_right: Anh chị em doanh nghiệp, đặc biệt là các công ty gia công, sản xuất linh kiện điện tử có dùng lao động thuê ngoài cần khẩn trương rà soát lại các hợp đồng cung ứng lao động để đối chiếu với danh mục công việc được phép, tránh việc bị loại toàn bộ chi phí tiền lương này khi quyết toán thuế TNDN và GTGT nhé.

Các anh/chị nếu có vướng mắc nào cụ thể trong thực tế công ty mình, cùng để lại bình luận để diễn đàn thảo luận thêm!

Chi tiết văn bản: https://drive.google.com/file/d/1mo7p2BdF1Vy5jGfJh1Wyvo3zahXuHvPO/view?usp=drive_link